Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms