Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX7O95931 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX7O95931 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX7O95931 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX7O95931 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms