Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POP4O95707 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POP4O95707 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POP4O95707 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms