Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms