Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms