Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNSO60931 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNSO60931 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms