Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms