Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
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