Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms