Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms