Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF839A8K0R7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms