Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RGPD3A6NKT7 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms