Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms