Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L5

RAP2C, Ras-related protein Rap-2c, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP2CQ9Y3L5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAP2CQ9Y3L5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms