Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms