Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms