Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms