Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCML1Q9UN30 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCML1Q9UN30 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms