Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms