Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RARRES3Q9UL19 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms