Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms