Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms