Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms