Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1L2Q9P2F8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms