Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN3Q9P232 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms