Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms