Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms