Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREX1Q9NSU2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms