Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6BQ9NRW1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms