Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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