Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms