Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms