Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms