Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms