Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms