Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms