Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms