Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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