Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms