Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms