Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC97Q96F63 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms