Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms