Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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