Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms