Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEO1Q92859 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEO1Q92859 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms