Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PROX1Q92786 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms