Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

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Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CNKSR2Q8WXI2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 KIZ-AS1-202ENST00000443753 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AC007342.1-201ENST00000565073 706 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AL360169.2-201ENST00000619713 561 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNKSR2Q8WXI2 CLEC5A-207ENST00000551012 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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