Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms