Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBRM1Q86U86 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms