Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms